Candidatus liberibacter asiaticus en citricultivos
datacite.rights | http://purl.org/coar/access_right/c_16ec | eng |
dc.contributor.advisor | Aranguren Díaz, Yani Cristina | |
dc.contributor.advisor | Machado Sierra, Elwi Guillermo | |
dc.contributor.author | Baza Bermúdez, Nicolle Esther | |
dc.contributor.author | Escobar Díaz, Jessica María | |
dc.contributor.author | Herrera Yepes, Andrés Elias | |
dc.date.accessioned | 2022-01-12T20:24:51Z | |
dc.date.available | 2022-01-12T20:24:51Z | |
dc.date.issued | 2021 | |
dc.description.abstract | Los frutos cítricos desempeñan un papel importante en la alimentación de millones de personas a nivel mundial, ya que son cultivos permanentes y poseen alta adaptabilidad a diversas condiciones climáticas. Existen numerosas enfermedades que afectan a los cítricos, de origen viral, fúngica, bacteriana o parasitaria. Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) es una bacteria Gram negativa que tiene la capacidad de alojarse en los tubos del tamiz del floema, lo que le permite moverse por toda la planta, para ubicarse en órganos con alta demanda de nutrientes. CLas es trasmitida por el insecto vector Diaphorina citri por medio del cual logra afectar a diferentes cultivos pertenecientes a la familia Rutaceae y causar la enfermedad conocida como Huanglongbing (HLB) o “enfermedad del dragón amarillo”. CLas altera funciones metabólicas de los carbohidratos celulares en plantas de cítricos; lo que produce la acumulación de almidón, sacarosa y glucosa, afectando el flujo de nutrientes en toda la planta y disminuyendo su capacidad fotosintética. El problema fitosanitario central radica en la dificultad de cultivar a CLas, por ser una bacteria fastidiosa, generando una demanda especial atención de estudio y búsqueda de métodos de diagnóstico y control de la enfermedad HLB. Por este motivo, el objetivo de este trabajo fue conocer la biología de Candidatus Liberibacter asiaticus. Para ello se realizó una revisión sobre sobre CLas y la enfermedad en Colombia. Además, se realizó un análisis bioinformático de los genes 23S y 16S. A partir de este se determinó que según 23S existen similitudes entre Oricola thermophila y según 16S Devosia spp., que se observó en agrupamientos basados en diferentes métodos, donde se mantuvo siempre la estructura topológica de este clado. La información recopilada y las secuencias analizadas reafirman la necesidad de conocer mejor el estado etiológico del HLB, en particular la caracterización genética, que permita manejar y controlar esta enfermedad que ha afectado tanto la citricultura del mundo entero. | spa |
dc.description.abstract | Citrus fruits play an important role in the diets of millions of people worldwide, as they are permanent crops and are highly adaptable to various climatic conditions. There are numerous 2 diseases affecting citrus fruits, of viral, fungal, bacterial or parasitic origin. Candidatus Liberibacter asiaticus (CLas) is a Gram-negative bacterium that has the ability to lodge in the sieve tubes of the phloem, which allows it to move throughout the plant, to locate in organs with high nutrient demand. CLas is transmitted by the insect vector Diaphorina citri through which it affects different crops belonging to the Rutaceae family and causes the disease known as Huanglongbing (HLB) or "yellow dragon disease". CLas alters metabolic functions of cellular carbohydrates in citrus plants, resulting in the accumulation of starch, sucrose and glucose, affecting the flow of nutrients throughout the plant and reducing its photosynthetic capacity. The central phytosanitary problem lies in the difficulty of cultivating CLas, as it is a fastidious bacterium, generating a special demand for study and search for methods of diagnosis and control of the HLB disease. For this reason, the objective of this work was to know the biology of Candidatus Liberibacter asiaticus. For this purpose, a review of CLas and the disease in Colombia was carried out. In addition, a bioinformatic analysis of the 23S and 16S genes was performed. From this, it was determined that according to 23S there are similarities between Oricola thermophila and 16S Devosia spp. according to 16S, which was observed in groupings based on different methods, where the topological structure of this clade was always maintained. The information gathered and the sequences analyzed reaffirm the need to better understand the etiological status of HLB, in particular the genetic characterization, which will allow the management and control of this disease that has affected citriculture worldwide. | eng |
dc.format.mimetype | spa | |
dc.identifier.uri | https://hdl.handle.net/20.500.12442/9271 | |
dc.language.iso | spa | spa |
dc.publisher | Ediciones Universidad Simón Bolivar | spa |
dc.publisher | Facultad Ciencias Básicas y Biomédicas | spa |
dc.rights | Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional | eng |
dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/restrictedAccess | eng |
dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ | |
dc.subject | Cítricos | spa |
dc.subject | Diaphorina citri | spa |
dc.subject | Huanglongbing | spa |
dc.subject | Filogénia | spa |
dc.subject | Fitopatógeno | spa |
dc.subject | Citrus | eng |
dc.subject | Diaphorina citri | eng |
dc.subject | Huanglongbing | eng |
dc.subject | Phylogenesis | eng |
dc.subject | Phytopathogen | eng |
dc.title | Candidatus liberibacter asiaticus en citricultivos | spa |
dc.type.driver | info:eu-repo/semantics/bachelorThesis | eng |
dc.type.spa | Trabajo de grado - pregrado | spa |
dcterms.references | Alejandro Orjuela-Garzón, W., Arlen Araque Echeverry, W., & Cabrera Pedraza, R. (2020). Identificación de tecnologías y métodos para la detección temprana del Huanglongbing (HLB) a través de cienciometría en artículos científicos y patentes. 5. https://doi.org/10.21930/rcta.vol21_num2_art:1208 | spa |
dcterms.references | Alejandro Orjuela-Garzón, W., Arlen Araque Echeverry, W., & Cabrera Pedraza, R. (2020). Identificación de tecnologías y métodos para la detección temprana del Huanglongbing (HLB) a través de cienciometría en artículos científicos y patentes. 5. https://doi.org/10.21930/rcta.vol21_num2_art:1208 | spa |
dcterms.references | Alemán, J., Baños, H., & Ravelo, J. (2007). Artículo reseña Diaphorina citri y la enfermedad huanglongbing: una combinación destructiva para la producción citrícola. In Rev. Protección Veg (Vol. 22, Issue 3). | spa |
dcterms.references | Araque, W., & Arévalo, E. (2018). Potencial distribución espacial del vector del HLB de los cítricos Diaphorina citri (Hemiptera: Liviidae) en el departamento del Tolima, Colombia. Revista Colombiana de Ciencias Hortícolas, 12(3), 545–560. https://doi.org/10.17584/rcch.2018v12i3.9521 | spa |
dcterms.references | Botero, V., Ochoa, A., Zamora, J. G., Ortiz, A., Fuel, S., Moná, E., Mejía, L. M., Guarin, J. H., Orduz, J., Chaparro, N., & Arévalo, E. (2014). Diaphorina citri. Identificación de la dinámica poblacional de Diaphorina citri (Hemiptera: Liviidae) en los cultivos de cítricos de Colombia: una herramienta para implementar un sistema piloto de seguimiento de poblaciones del insecto vector del HLB. Universidad de Nacional de Colombia, Sede Medellín. https://doi.org/10.13140/2.1.5056.6087 | spa |
dcterms.references | CCI Corporación Colombia Internacional. (n.d.). Retrieved March 7, 2021, from http://www.cci.org.co/inicio/ | spa |
dcterms.references | Choi, A. L., Grandjean, P., Sun, G., & Zhang, Y. (2013). Developmental Fluoride Neurotoxicity: Choi et al. Respond. In Environmental Health Perspectives (Vol. 121, Issue 3, p. a70). National Institute of Environmental Health Sciences. https://doi.org/10.1289/ehp.1206192R | eng |
dcterms.references | Corrales. (n.d.). Serie Lasallista Investigación y Ciencia CÍTRICOS: CULTIVO, POSCOSECHA E INDUSTRIALIZACIÓN. | spa |
dcterms.references | do Carmo Teixeira, D., Saillard, C., Eveillard, S., Danet, J. L., da Costa, P. I., Ayres, A. J., & Bové, J. (2005). “Candidatus Liberibacter americanus”, associated with citrus huanglongbing (greening disease) in São Paulo State, Brazil. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 55(5), 1857–1862. https://doi.org/10.1099/ijs.0.63677-0 | eng |
dcterms.references | Doe, D., Om, N., Dorji, C., Dorji, T., Garnier, M., Jagoueix-Eveillard, S., & Bové, J. M. (2003). First Report of “Candidatus Liberibacter asiaticus”, the Agent of Citrus Huanglongbing (Ex-greening) in Bhutan . Plant Disease, 87(4), 448–448. https://doi.org/10.1094/pdis.2003.87.4.448a | spa |
dcterms.references | Ebratt Ravelo, C., Emilio, E., González, R., Tatiana, L., Antonio, V., Gómez, Z., Milena, E., Ávila, C., Patricia, Á., Galindo, S., & Yohany, M. (2011). Revista Facultad Nacional de Agronomía-Medellín. Revista Facultad Nacional de Agronomía-Medellín, 64(2), 6141–6146. http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=179922664011 | spa |
dcterms.references | Fagen, J. R., Leonard, M. T., Coyle, J. F., McCullough, C. M., DavisRichardson, A. G., Davis, M. J., & Triplett, E. W. (2014). Liberibacter crescens gen. nov., sp. nov., the first cultured member of the genus Liberibacter. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 64(PART 7), 2461– 2466. https://doi.org/10.1099/ijs.0.063255-0 | eng |
dcterms.references | Gómez Barros, G. E. T. W. C. A. Á. P. Z. M. J. B. M. C. L. E. A. Á. M. P. R. A. R. G. V. L. F. (2008). Tecnología para el cultivo de los cítricos en la región caribe colombiana /. https://1library.co/document/yevd6p4z-tecnologia-cultivo-citricos-region-caribe-colombiana.html | spa |
dcterms.references | Hall, T. A. (1999). BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT. In Nucleic acids symposium series (Vol. 41, No. 41, pp. 95-98). [London]: Information Retrieval Ltd., c1979-c2000. | eng |
dcterms.references | Instituto Colombiano Agropecuario - ICA. (2011, September 18). La bacteria HLB que ataca los cítricos y su insecto vector. https://www.ica.gov.co/noticias/agricola/2011/la-bacteria-hlb-que-ataca-los-citricos-y-su-insect.aspx | spa |
dcterms.references | J.M. Bové. (2006). Huanglongbing: a destructive, newly-emerging, century-old disease of citrus. | eng |
dcterms.references | Jorge Luis Flores-Sánchez, Gustavo Mora-Aguilera 1, Emiliano Loeza-Kuk 2, J. Isabel López-Arroyo 3, Santiago Domínguez-Monge 1, Gerardo Acevedo-Sánchez 1, & Pedro Robles-García 4. (2015). Pérdidas en Producción inducidas por Candidatus Liberibacter asiaticus en Limón Persa, en Yucatán México. | eng |
dcterms.references | Munyaneza, J. E., Sengoda, V. G., Buchman, J. L., & Fisher, T. W. (2012). Effects of temperature on “Candidatus liberibacter” and zebra chip potato disease symptom development. Plant Disease, 96(1), 18–23. https://doi.org/10.1094/PDIS-03-11-0185 | eng |
dcterms.references | Nelson, W. R., Munyaneza, J. E., McCue, K. F., & Bové, J. M. (2013). The Pangaean origin of “Candidatus Liberibacter” species. Journal of Plant Pathology, 95(3), 455–461. https://doi.org/10.4454/JPP.V95I3.001 | eng |
dcterms.references | Olvera-Vargas, L. A., Quiroz Gaspar, Á. de J., Contreras-Medina, D. I., & Aguilar-Rivera, N. (2020). Análisis de riesgo potencial de Huanglongbing a través de tecnología geoespacial en Colombia. Ciencia & Tecnología Agropecuaria, 21(3), 1–23. https://doi.org/10.21930/rcta.vol21_num3_art:1552 | spa |
dcterms.references | Pedreira de Miranda, M., Takao Yamamoto, P., Beozzo Bassanezi, R., Aparecido Lopes, S., Belasque Júnior, J., Bellato Spósito, M., Juliano Ayres, A., & Elena Diaz Gil, M. (n.d.). Situación del huanglongbing (hlb) en brasil y manejo de la enfermedad. | spa |
dcterms.references | Pourreza, A., Lee, W. S., Etxeberria, E., & Zhang, Y. (2016). Identification of Citrus Huanglongbing Disease at the Pre-Symptomatic Stage Using Polarized Imaging Technique. IFAC-PapersOnLine, 49(16), 110–115. https://doi.org/10.1016/j.ifacol.2016.10.021 | eng |
dcterms.references | Raddadi, N., Gonella, E., Camerota, C., Pizzinat, A., Tedeschi, R., Crotti, E., Alma, A. (2011). “Candidatus Liberibacter europaeus” sp. nov. that is associated with and transmitted by the psyllid Cacopsylla pyri apparently behaves as an endophyte rather than a pathogen. Environmental Microbiology, 13(2), 414–426. https://doi.org/10.1111/j.1462- 2920.2010.02347.x | eng |
dcterms.references | Robles-González, M., Manuel, M., Orozco-Santos; Manzanilla-Ramírez, M.; Ángel; Velázquez-Monreal, M., Joaquín, J., Carrillo-Medrano; & Heréndira, S. (2017). Revista Mexicana de Ciencias Agrícolas. http://www.redalyc.org/articulo.oa?id=263152411008 | spa |
dcterms.references | Salinas, A., & Cantero, J. (2017). Análisis Filogenético de bacterias del genero Candidatus Liberibacter causantes del HLB en Cítricos y otras enfermedades en plantas vasculares. In Anais: I Seminário Internacional de Pós-Graduação em Desenvolvimento Rural Sustentável e IV Jornada Questão Agrária e Desenvolvimento (20th ed., Vol. 94). Marechal Candido Rondon: UNIOESTE-PPGDRS. Retrieved from https://midas.unioeste.br/sgev/event os/SIPGDRS/anais | eng |
dcterms.references | Sudhir Kumar, Glen Stecher, Michael Li, Christina Knyaz, and Koichiro Tamura (2018) MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across computing platforms. Molecular Biology and Evolution 35:1547-1549 | eng |
dcterms.references | Teixeira, D. A. B., & Borges, I. (2005). Effect of increasing level of whole cottonseed on intake and apparent digestibility of fiber fraction of Brachiaria decumbens hay in 26 sheep. Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinaria e Zootecnia, 57(2), 229–233. https://doi.org/10.1590/s0102-09352005000200015 | eng |
dcterms.references | Vegetale, P. (2011). Molecular characterization and phylogenetic analysis of 16s rRNA from a new “candidatus liberibacter” strain associated with zebra chip disease of potato (solanum tuberosum) and the potato psyllid (bactericera cockerelli sulc). Journal of Plant Pathology, 16–17b. | eng |
dcterms.references | Wang, N., Pierson, E. A., Setubal, J. C., Xu, J., Levy, J. G., Zhang, Y., Li, J., Rangel, L. T., & Martins, J. (2017). The Candidatus Liberibacter-Host Interface: Insights into Pathogenesis Mechanisms and Disease Control. In Annual Review of Phytopathology (Vol. 55, pp. 451–482). Annual Reviews Inc. https://doi.org/10.1146/annurev-phyto-080516-035513 | eng |
dcterms.references | Yudis, A., & Garcia, G. (2018). Análisis de experiencias en el mundo sobre la investigación y el manejo del huanglongbing (HLB) de los cítricos y la aplicación en colombia. | spa |
dcterms.references | Zhou, Y., Wei, X., Li, Y., Liu, Z., Duan, Y., & Zou, H. (2020). Candidatus liberibacter asiaticus SDE1 effector induces huanglongbing chlorosis by downregulating host DDX3 gene. International Journal of Molecular Sciences, 21(21), 1–13. https://doi.org/10.3390/ijms21217996 | eng |
oaire.version | info:eu-repo/semantics/acceptedVersion | eng |
sb.programa | Microbiología | spa |
sb.sede | Sede Barranquilla | spa |