Identificación y análisis In sílico de dominios conservados en el transportador de cromo CHRA de bacterias vinculadas a infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS)
| dc.contributor.author | Barros del Duca, Kevin Andrés | |
| dc.contributor.author | Padilla Morales, Luisa Fernanda | |
| dc.contributor.author | Ramírez Manotas, Andrea Carolina | |
| dc.contributor.author | Ribón Molina, Augusto Rafael | |
| dc.contributor.author | Sarabia Jiménez, Yulieth Elena | |
| dc.contributor.author | Sánchez Calderón, Juan David | |
| dc.contributor.author | Badillo Viloria, María Auxiliadora | |
| dc.date.accessioned | 2018-09-20T20:19:58Z | |
| dc.date.available | 2018-09-20T20:19:58Z | |
| dc.date.issued | 2018 | |
| dc.description.abstract | Las Infecciones Asociadas a la Atención en Salud (IAAS) son patologías adquiridas durante estadios en centros clínicos. Se ha demostrado que la diversidad de los agentes etiológicos relacionados con IAAS ha cambiado constantemente durante los últimos años, prevaleciendo bacterias Gram negativas. Estas bacterias comparten la secuencia génica chrA, que confiere resistencia al Cromo (Cr), metal altamente tóxico. Estudios han sugerido la existencia de posibles dominios proteicos conservados en ChrA, aunque no es clara su procedencia evolutiva. De tal manera, fue relevante analizar la correspondencia entre resistencia a metales pesados, presencia de factores de virulencia y susceptibilidad a antimicrobianos conforme la problemática mundial. El objetivo de este trabajo fue identificar y analizar In Sílico dominios conservados en el transportador de cromo ChrA de bacterias Gram negativas vinculadas a IAAS. Para esto se seleccionaron bibliográficamente bacterias Gram negativas prevalentes asociadas a IAAS, de las cuales se obtuvieron sus secuencias génicas usando la plataforma bioinformática NCBI (National Center for Biotechnology Information). Las secuencias génicas se tradujeron In sílico a cadena primaria aminoacídica y se confirmaron dichas secuencias, para subsiguientemente realizar un alineamiento múltiple In Sílico, tanto de nucleótidos como aminoácidos, en busca de regiones conservadas y patrones de secuencia. Se evidenció una posible existencia de regiones conservada del gen chrA en secuencias de varias especies bacterianas Gram negativas, así como en secuencias aminoacídicas de traducción In Sílico, posiblemente indicando transferencia horizontal de genes. | spa |
| dc.identifier.uri | http://hdl.handle.net/20.500.12442/2297 | |
| dc.language.iso | spa | spa |
| dc.publisher | Ediciones Universidad Simón Bolívar | spa |
| dc.publisher | Facultad de Ciencias Básicas y Biomédicas | spa |
| dc.rights.accessrights | info:eu-repo/semantics/restrictedAccess | |
| dc.rights.license | Licencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional | |
| dc.subject | Cromo | spa |
| dc.subject | In Sílico | spa |
| dc.subject | Resistencia antimicrobiana | spa |
| dc.subject | Infecciones Asociadas a la Atención en Salud (IAAS) | spa |
| dc.title | Identificación y análisis In sílico de dominios conservados en el transportador de cromo CHRA de bacterias vinculadas a infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) | spa |
| dc.type | Other | spa |
| dcterms.references | Molina F, Fonseca N, Jaramillo C, Mejía S, Arango J, Benítez F, et al. Epidemiología de las infecciones nosocomiales asociadas a dispositivos en 35 Unidades de Cuidados Intensivos de Colombia (2007-2008). Acta Colombia Unidad de Cuidados Intensivos. 2009. 9: p.9-23. | spa |
| dcterms.references | Pérez JD, Rodríguez García L, Alcalá-Cerra G. Mortalidad e infecciones nosocomiales en dos unidades de cuidados intensivos de la ciudad de Barranquilla (Colombia). Salud Uninorte, 2008; 24:74-86. | spa |
| dcterms.references | Martínez González L, Narváez J, Rua Z. De Avila W, Morales I, Maestre R. Caracterización Epidemiológica de Pacientes con Infección Respiratoria Aguda (IRA) en un Hospital de Segundo Nivel en la Región Caribe colombiana. Cienc. innov. salud. 2014; 2(1):82–87. | spa |
| dcterms.references | Cordero Ruíz DM, García Pérez AL, Barreal González RT, Jiménez Armada J, Rojas Hernández N. Comportamiento de la infección nosocomial en las unidades de terapia en un período de 5 años. Revista Cubana de Higiene y Epidemiologia. 2002. 40(2): p. 79-88. | spa |
| dcterms.references | Jara, M.A., P. Avendaño, and C. Navarro, Identificación y estudio de susceptibilidad antimicrobiana de bacterias potencialmente responsables de infecciones nosocomiales en los hospitales veterinarios de la Universidad de Chile. Avances en Ciencias Veterinarias, 2009. 24(1-2). | spa |
| dcterms.references | Mendívil C, Egüés J, Polo P, Ollaquindia P, Nuin M, Del Real C, editores. Infección nosocomial, vigilancia y control de la infección en Neonatología Nosocomial infection, surveillance and control in Neonatology infection. ANALES Sis San Navarra; 2000. | spa |
| dcterms.references | Arévalo H, Cruz R, Palomino F, Fernández F, Guzmán E, Melgar R. Aplicación de un programa de control de infecciones intrahospitalarias en establecimientos de salud de la región San Martín, Perú. Revista Peruana de Medicina Experimental y Salud Publica. 2003;20(2):84-91. | spa |
| dcterms.references | Martínez P, Mercado M, Máttar S. Determinación de B-lactamasas de espectro extendido en gérmenes nosocomiales del Hospital San Jerónimo, Montería. Colombia Médica. 2003;34(4):196-205. | spa |
| dcterms.references | García JJM, Cobián ZLL, Sicarios NL. Factores de riesgo para infecciones nosocomiales en niños con patología oncológica o hematológica. Pediatría de México. 2009;11(2):46-50. | spa |
| dcterms.references | Olaechea P, Insausti J, Blanco A, Luque P. Epidemiología e impacto de las infecciones nosocomiales. Medicina Intensiva. 2010;34(4):256-67. | spa |
| dcterms.references | Frías Salcedo JA. Burkholderia cepacia (B. cepacia) Nuevo patógeno de infecciones nosocomiales. Enfermedades Infecciosas y Microbiología. 2008;28(1):19-23. | spa |
| dcterms.references | Perez-Gonzalez LF, Ruiz-Gonzalez JM, Noyola DE. Nosocomial bacteremia in children: a 15-year experience at a general hospital in Mexico. Infection Control & Hospital Epidemiology. 2007;28(04):418-22. | eng |
| dcterms.references | Monchy S, Benotmane MA, Janssen P, Vallaeys T, Taghavi S, van der Lelie D, et al. Plasmids pMOL28 and pMOL30 of Cupriavidus metallidurans are specialized in the maximal viable response to heavy metals. Journal of bacteriology. 2007;189(20):7417-25. | eng |
| dcterms.references | Holden MT, Titball RW, Peacock SJ, Cerdeño-Tárraga AM, Atkins T, Crossman LC, et al. Genomic plasticity of the causative agent of melioidosis, Burkholderia pseudomallei. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2004;101(39):14240-5. | eng |
| dcterms.references | Bravo-Fariñas L, CABRERA-RODRÍGUEZ L, RAMÍREZ M, Llop-Hernández A, Verdecía-Pérez J, Borrego-Hernández G, et al. Resistencia antimicrobiana en cepas de Aeromonas spp. aisladas de pacientes con bacteriemia. Rev Biomed. 2007;18:176-81. | spa |
| dcterms.references | Cervantes C, Flores GGC, Sánchez JS, Ramírez MIRDI. Distribución de los genes chrA en bacterias de origen nosocomial. Ciencia Nicolaita. , 2012(56): p. 79-92. | spa |
| dcterms.references | Cuberos E, Rodriguez AI, Prieto-Suárez E. Niveles de cromo y alteraciones de salud en una población expuesta a las actividades de curtiembres en Bogotá, Colombia. Revista de Salud Pública. 2009;11(2):278-89. | spa |
| dcterms.references | de Jesús Román-Guzmán I, Torres-Villanueva R, Rodriguez-Andrada VA, Qui-Zapata J, Tapia-Campos E, Dupré P. Clonación y caracterización molecular In Sílico de dos fructosiltransferasas en Dahlia spp. | spa |
| dcterms.references | Muscio HJ. Transferencia horizontal, cladismo y filogenias culturales. Escacena, et al(Eds), Clasificación y Arqueología: Enfoques y métodos taxonómicos a la luz de la evolución darwiniana. 2010:225-52. | spa |
| dcterms.references | Barreto Hernández E, Reza R, Teresa M. Diseño de un modelo bioinformática para la detección, identificación y clasificación de genes codificantes de ß-lactamasas, como herramienta para el cruce de datos moleculares con datos clínicos. Revista Colombiana de Ciencias Químico-Farmacéuticas. 2007;36(2):109-26. | spa |
| dcterms.references | Moraga R, Merino C, Mondaca M. Resistencia a metales pesados en bacterias aisladas de la bahía de Iquique. Investigaciones marinas. 2003;31(1):91-5. | spa |
| dcterms.references | Marrero-Coto J, Díaz-Valdivia A, Coto-Pérez O. Mecanismos moleculares de resistencia a metales pesados en las bacterias y sus aplicaciones en la biorremediación. Revista CENIC Ciencias Biológicas. 2010;41(1) | spa |
| dcterms.references | Corona JFG, Saldaña ÁEE, Alonso AC, Aguilar FJA, López GER, Fernández FJ, et al. Mecanismos de interacción con cromo y aplicaciones biotecnológicas en hongos. Revista Latinoamericana de Biotecnología Ambiental y Algal. 2010. | spa |
| dcterms.references | Díaz-Pérez A, Castro Gil P, Badillo-Viloria M. Reflexión ontológica y epistemológica de la Microbiología. Escenarios Humanos. 2017; 1(2). | spa |
| dcterms.references | Pimentel, B.E., R. Moreno-Sánchez and C. Cervantes. 2002. Efflux of chromate by cells of Pseudomonas aeruginosa expressing the ChrA protein. FEMS Microbiol. Lett. 212:249-254. | eng |
| dcterms.references | Casey, R. M. (2005). "BLAST Sequences Aid in Genomics and Proteomics". Business Intelligence Network. | eng |
| dcterms.references | Álvarez López, C., Osorio Vega, N., & Marín Montoya, M. (2013). Molecular Identification of Microorganisms Associated to the Rhizosphere of Vanilla Plants in Colombia. Acta Biológica Colombiana, 18(2), 293-306 | eng |
| dcterms.references | Rani, R. Ranjani and D. Ramyachitra. "Multiple Sequence Alignment Using Multi-Objective Based Bacterial Foraging Optimization Algorithm." Biosystems 150, no. Supplement C (2016): 177-189. | eng |
| dcterms.references | Saitou N, Nei M. "The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees." Molecular Biology and Evolution, volumen 4, expedición 4, pp. 406-425, julio 1987 | eng |
| dcterms.references | Di Tommaso, P., Moretti, S., Xenarios, I., Orobitg, M., Montanyola, A., Chang, J.-M., ... Notredame, C. (2011). T-Coffee: un servidor web para la alineación de secuencias múltiples de secuencias de proteínas y ARN utilizando información estructural y extensión de homología. Nucleic Acids Research , 39 (problema del servidor web), W13-W17. | spa |
| dcterms.references | Organización Mundial de la Salud. Prevención de las infecciones nosocomiales. Guía prática. Vol. 2. 2002. p. 70. | spa |
| dcterms.references | Salcedo JAF. Burkholderia Cepacia (B. cepacia). Nuevo Patógeno De Infecciones Nosocomiales. Serie de Casos Clínicos. Enfermedades Infecc y Microbiol. 2008;28(1):19–23. | spa |
| dcterms.references | Herrera ML, Vargas A, Moya T, Campos M, Marín JP. Diarreas Invasivas por Aeromonas hydrophila. Rev Médica Del Hosp Nac Niños [Internet]. 2010;39(30):1–10. Available from: http://www.scielo.sa.cr/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1017-85462004000200004 | eng |
| dcterms.references | Luján Roca DÁ. Pseudomonas aeruginosa: Un Adversario Peligroso. Acta bioquamica clínica Latinoam [Internet]. 2014;48(4):465–74. Available from: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572014000400009 36. Matyar F, Kaya A, Dinçer S. Antibacterial Agents and Heavy Metal Resistance in Gram-Negative Bacteria Isolated from Seawater, Shrimp and Sediment in Iskenderun Bay, Turkey. Sci Total Environ. 2008;407(1):279–85. | eng |
| dcterms.references | Ronconi MC, Merino LA, Fernández G. Caracterización del Perfil de Susceptibilidad Antibiótica de Cepas de Enterococcus Aisladas de Lactuca sativa (Lechuga) [Internet]. Instituto de Medicina Regional - UNNE. Chaco-Argentina; 2001. p. 3. Available from: http://www.unne.edu.ar/unnevieja/Web/cyt/cyt/2002/03-Medicas/M-030.pdf | spa |
| dcterms.references | Kimiran-Erdem A, Arslan-Aydoğdu EÖ, Gürün S, Altun Ö. Determination of Multiple Antibiotic and Heavy Metal Resistance of the Bacteria Isolated from the Küçükçekmece Lagoon, Turkey. Polish J Environ Stud. 2015;24(3):1077–84. 39. Barrios RLA, Sierra CAS, Morales JDCJ. Bacterias Resistentes a Antibióticos en Medios Acuáticos. Prod + Limpia [Internet]. 2015;10(2):160–72. Available from: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S190904552015000200015&lng=en&nrm=iso&tlng=es | eng |
| dcterms.references | Stepanauskas R, Glenn TC, Jagoe CH, Tuckfield RC, Lindell AH, King CJ, et al. Coselection for Microbial Resistance to Metals and Antibiotics in Freshwater Microcosms. Environ Microbiol. 2006;8(9):1510–4. | eng |
| dcterms.references | Wright MS, Peltier GL, Stepanauskas R, McArthur JV. Bacterial Tolerances to Metals and Antibiotics in Metal-Contaminated and Reference Streams. FEMS Microbiol Ecol. 2006; 58:293–302. | eng |
| dcterms.references | Moraga R, Merino C, Mondaca MA. Resistencia a metales pesados en bacterias aisladas de la bahía de Iquique. Investig Mar. 2003;31(1):91–5. | spa |
| dcterms.references | Moreno Contreras M, Bravo Patiño A, Cervantes C. Papel de Residuos Básicos de la Proteína ChrA de Pseudomonas aeruginosa. Cienc Nicolaita. 2007; 46:89–104. | spa |
| dcterms.references | Flores GGC, Sánchez JS, Cervantes C, Díaz MIR. Distribución de los genes chrA en bacterias de origen nosocomial*. Cienc Nicolaita. 2012; 327:148–54. | spa |
| dcterms.references | Martínez A, Cruz M, Veranes O, Carballo ME, Salgado I, Olivares S, et al. Resistencia a Antibióticos y a Metales Pesados en Bacterias Aisladas del Río Almendares. Antibiotic. Rev CENIC Ciencias Biológicas ISSN. 2010; 41:1–10. | spa |
| dcterms.references | Ridgway HF, Olson BH. Scanning Electron Microscope Evidence for Bacterial Colonization of a Drinking-Water Distribution System. Appl Environ Microbiol. 1981;41(1):274–87. | eng |
| dcterms.references | Allen MJ, Taylor RH, Geldreich EE. The Ocurrence of Microorganisms in Water Main Encrustations. Am Water Work Assoc. 1980;72(11):614–25. | eng |
| dcterms.references | Ramírez-Díaz MI, Díaz-Magaña A, Meza-Carmen V, Johnstone L, Cervantes C, Rensing C. Nucleotide sequence of Pseudomonas aeruginosa conjugative plasmid pUM505 containing virulence and heavy-metal resistance genes. Plasmid. 2011;66(1):7–18. | eng |
| dcterms.references | Cervantes C, Ohtake H, Chu L, Misra TK, Silver S. Cloning, Nucleotide Sequence, and Expression of the Chromate Resistance Determinant of Pseudomonas aeruginosa Plasmid pUM5O5. J Bacteriol. 1990;172(1):287–91. | eng |
| dcterms.references | Veranes O. Evaluación de la resistencia a antibióticos y a metales pesados en aislados bacterianos del río almendares. 2013; 74(1):4-7. | spa |
| sb.programa | Microbiología | spa |
| sb.sede | Sede Barranquilla | spa |
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