Examinando por Autor "Pacheco Lugo, Lisandro"
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Ítem Avances investigativos en nefritis lúpica(Ediciones Universidad Simón Bolívar, 2020) Aroca Martínez, Gustavo; Vélez-Verbel, María D.; González-Torres, Henry J.; De La Cruz, Fernando; Navarro Quiroz, Roberto; Navarro Quiroz, Elkin; Pacheco Lugo, Lisandro; Arrieta Bravo, Valentina; Díaz Olmos, Yirys; Gómez Escorcia, Lorena; Acosta-Hoyos, Antonio J.El lupus eritematoso sistémico (LES) es una enfermedad autoinmune recurrente-remitente caracterizada por la pérdida de tolerancia a los ácidos nucleicos y manifestaciones clínicas muy diversas. la heterogeneidad clínica, junto con la posible gravedad de estas manifestaciones, hacen que el tratamiento del LES sea un desafío distinto. A pesar de los avances recientes en los protocolos de tratamiento, varios estudios han señalado que los pacientes con LES todavía tienen un riesgo general de muertes de 2 a 3 veces mayor. Adicionalmente, existe grandes desafíos a nivel diagnóstico y la búsqueda de biomarcadores que permitan una rápida detención de afecciones como la real. El libro Avances Investigativos en Nefritis Lúpica compila conocimientos recientes sobre la base genética, molecular de la nefritis lúpica, nuevos biomarcadores diagnóstico, su potencial uso y el rol de las infecciones en esta enfermedad.Ítem Búsqueda de biomarcadores de daño renal en pacientes con lupus eritematoso sistémico a través un abordaje metabolómico no dirigido(Ediciones Universidad Simón Bolívar, 2023) Rojo Sánchez, Alejandra; Pacheco Lugo, LisandroEl lupus eritematoso sistémico (LES) es la enfermedad autoinmune multiorgánica prototípica, que se relaciona con una alta morbilidad y muerte temprana de personas en edad productiva. La nefritis lúpica (NL) es una de las mayores complicaciones del LES ya que se presenta en el 50% de los pacientes diagnosticados con esta enfermedad. El diagnóstico y la clasificación de la NL se basa en los resultados histopatológicos de la biopsia renal, sin embargo, a pesar de ser el estándar de oro, la biopsia sigue siendo un método altamente invasivo y poco práctico para el monitoreo en tiempo real del estadio de la NL. El presente estudio se diseñó para encontrar nuevos biomarcadores en muestras de orina que pudieran diferenciar entre los pacientes con LES y aquellos con NL utilizando un método de metabolómica no dirigida basado en cromatografía líquida acoplada a espectrometría de masas (CL-QTOF-EM). Se recolectaron muestras de orina de 50 sujetos que acudieron a consulta externa de nefrología en la Clínica de la Costa, incluyendo controles sanos, sujetos con LES y con LN clase III y clase IV. Las muestras se analizaron posteriormente mediante LC-QTOF-MS, por medio de lo cual se identificaron 38 metabolitos con diferencia significativa entre los grupos de LES y de NL. Luego, estos metabolitos se correlacionaron a vías metabólicas que podrían estar implicadas en la progresión del LN. Adicionalmente, tres metabolitos, el monopalmitin, el ácido glutámico y el ácido glicocólico, demostraron un alto poder predictivo como posibles biomarcadores para el diagnóstico de la NL. Estos hallazgos no solo proporcionan nuevos conocimientos sobre la firma metabólica urinaria del SLE y la NL; también proponen una alternativa diagnostica para la discriminación de la NL en sujetos con LES.Ítem Explorando el poder de los abordajes transcriptómicos para identificar biomarcadores asociados a daño renal en pacientes con lupus eritematoso sistémico(Asociación Colombiana de Nefrología e hipertensión Arterial, 2021) Arrieta Bravo, Valentina; Rangel Gómez, Tiffany; Pacheco Lugo, LisandroEl lupus eritematoso sistémico (LES) es una enfermedad compleja y altamente heterogénea que afecta múltiples órganos, incluyendo articulaciones, corazón, sistema hematopoyético, sistema nervioso y riñón, siendo este último el de peor pronóstico y el que conlleva a nefritis lúpica (NL). Aunque la etiopatogénesis del LES aún no se conoce con claridad, se cree que la susceptibilidad genética y las modificaciones epigenéticas aberrantes favorecen su desenlace. Para establecer una terapia precisa es necesario evaluar de manera eficiente y objetiva el compromiso de órganos y la actividad de la enfermedad, lo cual es muy difícil por las pocas pruebas de laboratorio clínico disponibles en la actualidad. En las últimas décadas la búsqueda de nuevos biomarcadores de LES ha sido una tendencia y se han identificado varios promisorios a nivel de genómica, metabolómica, proteómica y transcriptómica. En esta revisión se resume el estado del arte relacionado con estudios transcriptómicos que han identificado diversos transcritos potencialmente útiles como biomarcadores del LES y la NLÍtem From Cell to Symptoms: The Role of SARS-CoV-2 Cytopathic Effects in the Pathogenesis of COVID-19 and Long COVID(MDPI, 2023) Gonzalez-Garcia, Pablo; Fiorillo Moreno, Ornella; Pacheco Lugo, Lisandro; Acosta Hoyos, Antonio; Villarreal Camacho, José Luis; Navarro Quiroz, Roberto; Pacheco Londoño, Leonardo; Aroca Martínez, Gustavo; Moares, Noelia; Gabucio, Antonio; Fernández-Ponce, Cecilia; Garcia-Cozar, Francisco; Navarro Quiroz, ElkinSevere Acute Respiratory Syndrome CoronaVirus 2 (SARS-CoV-2) infection triggers var-ious events from the molecular to the tissue level, which in turn is given by the intrinsic character-istics of each patient. Given the molecular diversity characteristic of each cellular phenotype, the possible cytopathic, tissue, and clinical effects are difficult to predict, which determines the hetero-geneity of COVID-19 symptoms. The purpose of this article is to provide a comprehensive review of the cytopathic effects of SARS-CoV-2 on various cell types, focusing on the development of COVID-19, which in turn may lead, in some patients, to the persistence of symptoms after recovery from the disease, a condition known as long COVID. We describe the molecular mechanisms un-derlying virus–host interactions, including alterations in protein expression, intracellular signaling pathways, and immune responses. In particular, the article highlights the potential impact of these cytopathies on cellular function and clinical outcomes, such as immune dysregulation, neuropsy-chiatric disorders, and organ damage. The article concludes by discussing future directions for re-search and implications for the management and treatment of COVID-19 and long COVID.Ítem Integrated analysis of microRNA regulation and its interaction with mechanisms of epigenetic regulation in the etiology of systemic lupus erythematosus(Public Library of Science, 2019) Navarro Quiroz, Elkin; Navarro Quiroz, Roberto; Pacheco Lugo, Lisandro; Aroca Martínez, Gustavo; Gómez Escorcia, Lorena; Gonzalez Torres, Henry; Cadena Bonfanti, Andres; Marmolejo, Maria del Carmen; Sanchez, Eduardo; Villarreal Camacho, Jose Luis; Lorenzi, Hernan; Torres, Augusto; Navarro, Kelvin Fernando; Navarro Rodriguez, Pablo; Villa, Joe Luis; Fernández- Ponce, CeciliaThe aim of this study was to identity in silico the relationships among microRNAs (miRNAs) and genes encoding transcription factors, ubiquitylation, DNA methylation, and histone modifications in systemic lupus erythematosus (SLE). To identify miRNA dysregulation in SLE, we used miR2Disease and PhenomiR for information about miRNAs exhibiting differential regulation in disease and other biological processes, and HMDD for information about experimentally supported human miRNA–disease association data from genetics, epigenetics, circulating miRNAs, and miRNA–target interactions. This information was incorporated into the miRNA analysis. High-throughput sequencing revealed circulating miRNAs associated with kidney damage in patients with SLE. As the main finding of our in silico analysis of miRNAs differentially expressed in SLE and their interactions with disease-susceptibility genes, post-translational modifications, and transcription factors; we highlight 226 miRNAs associated with genes and processes. Moreover, we highlight that alterations of miRNAs such as hsa-miR-30a-5p, hsa-miR-16-5p, hsa-miR-142-5p, and hsa-miR-324-3p are most commonly associated with post-translational modifications. In addition, altered miRNAs that are most frequently associated with susceptibility-related genes are hsa-miR-16-5p, hsamiR- 374a-5p, hsa-miR-34a-5p, hsa-miR-31-5p, and hsa-miR-1-3p.Ítem Mutaciones kdr y su asociación con resistencia a piretroides en dos poblaciones de Aedes aegypti (Díptera: Culicidae) del departamento de Córdoba-Colombia.(Ediciones Universidad Simón Bolívar, 2024) Diaz Ortiz, Diana Patricia; Pareja Loaiza , Paula Ximena; Pacheco Lugo, LisandroSegún la Organización Mundial de la Salud, el dengue es un problema de salud pública creciente con más de seis millones de casos reportados y seis mil muertes a nivel mundial hasta la fecha. El principal vector de estas enfermedades y otras como Chikungunya y Zika es Ae. aegypti. Estas arbovirosis se han convertido en una emergencia global y al no existir una vacuna que sea accesible para todas las comunidades, las principales estrategias para su control se centran en el manejo integrado del vector, las cuales van principalmente orientadas a la reducción de la población del mosquito; algunas de las acciones se basan en la eliminación de criaderos como botellas, llantas, albercas, tanques, entre otros depósitos con agua ubicados al interior o fuera de las viviendas y también se ha determinado el uso de insecticidas como control químico tales como: organoclorados, carbamatos, organofosforados y piretroides. Para el control del vector del dengue en el departamento de Córdoba se han usado los insecticidas principalmente piretroides, lo que ha generado presión de selección constante y la aparición de poblaciones resistentes, teniendo en cuenta que esta presión con insecticidas viene dada por el incremento de casos de dengue y por el ingreso de los arbovirus chikungunya y Zika al país. En el presente estudio con el fin de determinar el estado de susceptibilidad a piretroides y su asociación con las mutaciones Kdr F1534, V410L y V1016I en las poblaciones de Ae. aegypti de Cereté y Valencia del departamento de Córdoba-Colombia, se realizaron bioensayos aplicando la metodología propuesta por la OMS para lambdacialotrina, deltametrina y permetrina en hembras Ae. aegypti de la generación F1 de los municipios de Valencia y Cereté; se identificaron las mutaciones F1534C, V410L y V1016I, se calcularon sus frecuencias alélicas y genotípicas y se determinó la asociación de estas mutaciones con la resistencia observada a los piretroides evaluados. De acuerdo con los resultados obtenidos se encontró que las poblaciones evaluadas se comportaron resistentes a lambdacialotrina (12% y 14% de mortalidad), deltametrina (19% y 38% de mortalidad) y permetrina (0% y 8% de mortalidad). Se identificaron las mutaciones Kdr con frecuencia alélica C1534 de 0,98 para Cereté y de 0,94 para Valencia, L410 las frecuencias fueron 0,40 para Cereté y para Valencia 0,20 y para I1016 0,43 para Cereté y de 0,20 para Valencia. Así mismo se identificó asociación significativa del alelo mutante I1016 con resistencia a lambdacialotrina y deltametrina. Para el alelo L410 se observó asociación con resistencia a lambdacialotrina. No se determinó asociación de la mutación F1534C a ninguno de los tres insecticidas evaluados, porque la mutación se encontró con frecuencias alélicas entre 0,94 y 0,98. Los resultados obtenidos de este trabajo generarán información para la vigilancia de la resistencia de poblaciones de Ae. aegypti a insecticidas piretroides, así como los mecanismos causantes de la resistencia, en todo el departamento de Córdoba, lo que resultaría útil para el fortalecimiento de las políticas públicas para el control vectorial a nivel nacional y departamental.Ítem Perfil metabolómico y espectroscópico urinario asociado a daño renal en una cohorte de pacientes colombianos con lupus eritematoso sistémico(Ediciones Universidad Simón Bolívar, 2023) Carmona Martes, Ada Luz; Pacheco Lugo, Lisandro; Pacheco Londoño, LeonardoEl lupus Eritematosos sistémico (LES) es una enfermedad de carácter autoinmune, crónica, multifactorial que puede afectar y ocasionar daño a cualquier órgano del cuerpo entre ellos el riñón, que se caracteriza por la activación de los linfocitos B y T, acumulación de depósitos inmunes y producción de citocinas promoviendo el daño tisular. La afectación del riñón se conoce como Nefritis Lúpica (NL), es diagnosticada mediante biopsia y se caracteriza por que produce depósitos de complejos inmunes en este órgano, autoanticuerpos que atacan ácidos nucleícos endógenos, las trampas extracelulares de neutrófilos y activación de la respuesta inmune tanto innata como adaptativa. El estudio de la orina proporciona información sobre el metaboloma de pacientes con NL con la finalidad de detectar metabolitos que puedan emplearse como biomarcadores diagnósticos y pronósticos para ser utilizados de forma alternativa respecto a la biopsia, por lo tanto identificar metabolitos urinarios en pacientes con NL se constituye en el objetivo esencial de este estudio empleando para ello cromatografía de gases acoplada a espectrometría de masas cuádruplo (GC-QTOFMS) aplicado a muestras de orina de 50 individuos correspondientes a 6 pacientes con NL grado III, 17 con NL grado IV, 17 pacientes con Lupus Eritematoso Sistémico sin Nefritis y 10 individuos clínicamente sanos pareados por edad y sexo. De los metabolitos detectados, 17 presentaron significancia estadística tras el análisis univariado y multivariado y que posteriormente mediante las características operativas del operador el Monopalmitín y el Nmetil glutámico resultaron aumentados de forma significativa en la orina de pacientes con NLIII y IV en comparación con los otros grupos de estudio, lo que representa un gran potencial de estos metabolitos como biomarcadores metabólicos diferenciales para daño renal, sin embargo es importante que estos sean más evaluados respecto a su sensibilidad y especificidad entre otros factores y ser propuestos como biomarcadores para daño renal. la técnica Raman se realizó a 235 muestras de orina correspondientes a 70 pacientes diagnosticados con LES sin Nefritis, 93 con NL y 72 controles sanos, se aplicó análisis multivariado a partir de PLSDA que dio lugar a tres modelos: Lupus (C vs L, NL); modelo Nefritis Lúpica (C, L vs NL); Nefritis Lúpica (C vs NL), los que fueron evaluados a partir de los parámetros de la matriz de confusión a partir de la sensibilidad y especificidad, donde el modelo de C vs NL presentó una sensibilidad de 1.0 y una especificidad de 0.944, a su vez el análisis llevado a cabo mediante las características operativas del receptor(ROC) dio lugar al área bajo la curva(AUC), siendo el valor de 0,995, el más alto para el modelo NL frente a C,L tanto para el de predicción como para el de validación cruzada(CV). Tambien se tuvo en cuenta aquellas variables importantes(VIP) que aportaron a los modelos, logrando identificar aquellas regiones espectrales que hicieron su mejor aporte a los modelos, se identificaron 24 señales importantes con un valor VIP 3 como fosfatidilinositol, creatinina, valina, glicerol, además se comprobó el carácter predictivo del modelo a partir de un paciente solo con LES y que a la fecha de 2021 el modelo predijo con una probabilidad de 0,5 para NL , luego en el 2023 no solo fue diagnosticado sino que además el modelo logró predecir NL con una probabilidad de 1. El hecho de que estos metabolitos o señales identificados desde la metabolómica y espectroscopia Raman respectivamente sigan siendo evaluados abre la posibilidad de ser propuestos como biomarcadores no solo para diagnóstico sino además como una forma de hacer seguimiento a la enfermedad y evaluación del tratamiento tanto en LES como en NL