Logotipo del repositorio
Logotipo del repositorio
 

Discriminación e identificación rápida de bacterias empleando técnicas espectrocopicas y análisis multivariado

Vista sencilla de ítem
dc.contributor.authorBarrios Caballero, Edwin
dc.contributor.authorRamírez Olivero, Kevin
dc.contributor.authorGalán Freyle, Nataly Julieth
dc.contributor.authorBadillo Viloria, María Auxiliadora
dc.date.accessioned2018-09-20T16:30:08Z
dc.date.available2018-09-20T16:30:08Z
dc.date.issued2018
dc.description.abstractLa detección y discriminación rápida de bacterias por medio de técnicas que empleen menos tiempo es una necesidad en el sector productivo e industrial, principalmente la industria farmacéutica y de alimentos, que requieren disminuir considerablemente el tiempo en la validación de los procesos de limpieza, para ello es indispensable la identificación de los diferentes tipos de bacterias presentes en las superficies metálicas de los contenedores de producción para evitar cualquier tipo de contaminación en sus productos. El objetivo de este trabajo fue evaluar la espectroscopia UV-Vis e Infrarroja como método analítico costo-efectivo y alternativo para la rápida discriminación e identificación de diferentes bacterias depositadas en superficie metálica, para posibles aplicaciones industriales. Inicialmente se seleccionaron 17 cepas de bacterias con características diferenciales en cuanto a estructuras como pared celular, membrana y/o capsulas y características taxonómicas, se acondicionaron los inóculos bacterianos y se procedió a realizar los análisis espectroscópicos en superficie metálica a partir de técnicas alternativas como la espectroscopia FT-IR con cristal de ATR y la espectroscopia UV-Vis, finalmente se aplicaron herramientas estadísticas para la discriminación de microorganismos como el análisis multivariado. Los resultados obtenidos ponen de manifiesto que un volumen de 1 uL depositados es una placa de aluminio, es suficiente para detectar las señales espectroscópicas de diferentes géneros de bacterias. Se concluyó, que los mejores modelos de discriminación fueron los desarrollados por espectroscopia FT-IR y la causa de la separación entre las clases, es la alteración en la estructura secundaria de las proteínas de las membranas de las bacterias cuando éstas interactúan con la radiación infrarroja, generando unos espectros específicos y característicos de cada bacteria.spa
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12442/2295
dc.language.isospaspa
dc.publisherEdiciones Univerisidad Simón Bolívarspa
dc.publisherFacultad de Ciencias Básicas y Biomédicasspa
dc.rights.accessrightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.licenselicencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
dc.subjectEspectroscopía infrarrojaspa
dc.subjectEspectroscopía UV-Visiblespa
dc.subjectPCA Análisis de componentes principalesspa
dc.subjectBacteriasspa
dc.titleDiscriminación e identificación rápida de bacterias empleando técnicas espectrocopicas y análisis multivariadospa
dc.typeOtherspa
dcterms.referencesGarcía P, Allende F, Legarraga P, Huilcaman M, Solari S. Identificación bacteriana basada en el espectro de masas de proteínas: Una nueva mirada a la microbiología del siglo XXI. Rev Chil Infectol. junio de 2012;29(3):263-72.spa
dcterms.referencesGarip S, Gozen AC, Severcan F. Use of Fourier transform infrared spectroscopy for rapid comparative analysis of Bacillus and Micrococcus isolates. Food Chem. abril de 2009;113(4):1301-7.eng
dcterms.referencesBava L ines nieto Ana Silvia Donolo Amadeo Javier, Osvaldo Miguel Yantorno. Empleo de espectroscopia infrarroja- transformada de Fourier para diferenciar bacterias de importancia clínica [Internet]. scielo.org. 2004 [citado 23 de mayo de 2017]. Disponible en: http://www.scielo.org.ar/pdf/abcl/v38n3/v38n3a03.pdfspa
dcterms.referencesLUIS E. NIETO BARAJAS. Análisis Multivariados [Internet]. ITAM. [citado 23 de mayo de 2017]. Disponible en: http://allman.rhon.itam.mx/~lnieto/index_archivos/Modulo61.pdfspa
dcterms.referencesOliveira AC de, Silva RS, Díaz MEP, Iquiapaza RA. Bacterial Resistance and Mortality in an Intensive Care Unit. Rev Lat Am Enfermagem. diciembre de 2010;18(6):1152-60.eng
dcterms.referencesHolmes B, Willcox WR, Lapage SP. Identification of Enterobacteriaceae by the API 20E system. J Clin Pathol. enero de 1978;31(1):22-30.eng
dcterms.referencesPantoja G, Cristina B, González P, Andrea C. Validación del método de PCR en tiempo real para la determinación cualitativa de Salmonella spp. En agua potable y agua de mar, barranquilla, 2014-2015. [Internet]. 2016 [citado 14 de septiembre de 2018]. Disponible en: http://bonga.unisimon.edu.co/handle/123456789/1517spa
dcterms.referencesH. A. Videla. Biocorrosion and biofouling of metals and alloys of industrial usage. Present state of the art at the beginning of the new millennium - 1140 [Internet]. Revista de Metalurgica. 2003 [citado 23 de mayo de 2017]. Disponible en: http://revistademetalurgia.revistas.csic.es/index.php/revistademetalurgia/article/viewFile/11 28/1140eng
dcterms.referencesAmaranto Natera D, Gutiérrez J, Luz D, Sánchez Polo D. Análisis de homologías de secuencias de los genes aprA Y dsrA implicados en el proceso de sulfato reducción. [Internet]. 2016 [citado 14 de septiembre de 2018]. Disponible en: http://bonga.unisimon.edu.co/handle/123456789/1513spa
dcterms.referencesPatricia S. Guiamet SGG de S. Inhibición de la adherencia bacteriana a superficies metálicas por cubiertas de origen biológico [Internet]. 2003 [citado 23 de mayo de 2017]. Disponible en: http://www.fcnym.unlp.edu.ar/uploads/docs/rmlp_tyd_2003_n43.pdfspa
dcterms.referencesÁbalos C. Adhesión bacteriana a biomateriales. Av En Odontoestomatol. febrero de 2005;21(1):347-53.spa
dcterms.referencesOMS | Una atención más limpia es una atención más segura [Internet]. WHO. [citado 29 de julio de 2017]. Disponible en: http://www.who.int/gpsc/background/es/spa
dcterms.referencesMowafak Nassani, Ph.D. untitled - Cleaning Validation in the Pharmaceutical Industry_0.pdf [Internet]. [citado 26 de julio de 2017]. Disponible en: http://www.ivtnetwork.com/sites/default/files/Cleaning%20Validation%20in%20the%20Ph armaceutical%20Industry_0.pdfeng
dcterms.referencesLopera Marriaga B, Muñoz Mejía G, Vides Fabregas A. Validación secundaria del método de detección microbiológico de Salmonella spp en alimentos para el laboratorio de investigación en microbiología de la Universidad Simón Bolívar- Barranquilla Colombia. [Internet]. 2016 [citado 14 de septiembre de 2018]. Disponible en: http://bonga.unisimon.edu.co/handle/123456789/1519spa
dcterms.referencesMollinedo Patzi MA, Gonzáles Villalobos C. Bacterias Gram Negativas. Rev Actual Clínica Investiga. /;2609.spa
dcterms.referencesBinkley CE, Cinti S, Simeone DM, Colletti LM. Bacillus Anthracis as an Agent of Bioterrorism. Ann Surg. julio de 2002;236(1):9-16.eng
dcterms.referencesJaime R. Torres R. CGTV. Bioterrorismo. La experiencia con el ántrax [Internet]. [citado 23 de mayo de 2017]. Disponible en: http://vitae.ucv.ve/pdfs/VITAE_3002.pdf 18. MICROBIOLOGÍA FORENSE - 991 [Internet]. [citado 29 de julio de 2017]. Disponible en: http://revistareduca.es/index.php/biologia/article/viewFile/983/991spa
dcterms.referencesMadigan, M. T., Martinko, J. M., y Parker, J. Brock Biología de los Microorganismos. 10a edición. Prentice-Hall. Madrid, 2003. Madigan, M. T., Martinko, J. M., y Parker, J. Brock Biología de los Microorganismos. 10a edición. Prentice-Hall. Madrid, 2003.Universidad de Navarra [Internet]. 2005 [citado 22 de julio de 2017]. Disponible en: http://www.unav.es/microbiol/microbio/pagina_5.htmlspa
dcterms.referencesJ. L. López-Hontangas FJC y MS. Técnicas de identificación [Internet]. [citado 24 de mayo de 2017]. Disponible en: http://media.axon.es/pdf/65248.pdfspa
dcterms.referencesHolmes B, Willcox WR, Lapage SP. Identification of Enterobacteriaceae by the API 20E system. J Clin Pathol. enero de 1978;31(1):22-30.eng
dcterms.referencesArderiu XF. Bioquímica clínica y patología molecular. Reverte; 1997. 604 p.spa
dcterms.referencesMicrosoft Word - ANEXOS.doc - PR-F-Anexos.pdf [Internet]. [citado 27 de julio de 2017]. Disponible en: http://ocw.uc3m.es/ingenieria-quimica/quimica-ii/practicas-1/PR-FAnexos. pdfspa
dcterms.referencesEl espectro electromagnetico y sus aplicaciones - espectro_electromagnetico.pdf [Internet]. [citado 27 de julio de 2017]. Disponible en: http://www.saber.ula.ve/bitstream/123456789/16746/1/espectro_electromagnetico.pdfspa
dcterms.referencesGarcía M del CS. Técnico especialista en laboratorio de atención primaria del instituto catalán de la salud. Temario volumen i. MAD-Eduforma; 2006. 431 p.spa
dcterms.referencesBÁRBARA JESÚS PRUNEDA DE LA FUENTE. - tesis_bpruneda.pdf [Internet]. capitulo 2: Descripción de las técnicas utilizadas. [citado 7 de octubre de 2017]. Disponible en: http://fisica.usach.cl/sites/fisica/files/tesis_bpruneda.pdf 27. Johana Paola Bonett Jiménez. Uso de la espectroscopía de reflectancia difusa (MIR) para la determinación de las propiedades químicas en suelos agrícolas de Colombia [Internet]. [citado 24 de mayo de 2017]. Disponible en: http://www.bdigital.unal.edu.co/45658/1/25785983.2013.pdfspa
dcterms.referencesItenge T., Hickford JG., Forrest RH., McKenzie G., Frampton C. Improving the quality of wool through the use of gene markers. South Afr J Anim Sci [Internet]. 21 de octubre de 2010 [citado 24 de mayo de 2017];39(1). Disponible en: http://www.ajol.info/index.php/sajas/article/view/61191eng
dcterms.referencesMaquelin K, Choo-Smith L-P, Endtz HP, Bruining HA, Puppels GJ. Rapid Identification of Candida Species by Confocal Raman Microspectroscopy. J Clin Microbiol. 1 de febrero de 2002;40(2):594-600.eng
dcterms.referencesInfrared spectroscopy of proteins [Internet]. [citado 12 de octubre de 2017]. Disponible en: http://scihub. cc/http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0005272807001375?via%3Dihubeng
dcterms.referencesJohn Wiley & Son. «Fourier Transform Infrared (FTIR) Spectroscopy». In: Encyclopedia of Life Sciences (ELS) - molecular structure chemical FTIR.pdf [Internet]. [citado 24 de mayo de 2017]. Disponible en: file:///C:/Users/Usuario/AppData/Roaming/Zotero/Zotero/Profiles/3irqpqln.default/zotero/s torage/UHEBKQUK/molecular%20structure%20chemical%20FTIR.pdfeng
dcterms.referencesHarz M, Rösch P, Popp J. Vibrational spectroscopy—A powerful tool for the rapid identification of microbial cells at the single-cell level. Cytometry A. 1 de febrero de 2009;75A(2):104-13.eng
dcterms.referencesJames R Schott. Principles of Multivariate Analysis: A User’s Perspective. [citado 24 de mayo de 2017]; Disponible en: http://sci-hub.cc/10.1198/jasa.2002.s479spa
dcterms.referencesJolliffe. Jolliffe I. Principal Component Analysis (2ed., Springer, 2002)(518s)_MVsa_.pdf [Internet]. 2da ed. [citado 24 de mayo de 2017]. Disponible en: http://cda.psych.uiuc.edu/statistical_learning_course/Jolliffe%20I.%20Principal%20Compo nent%20Analysis%20(2ed.,%20Springer,%202002)(518s)_MVsa_.pdfeng
dcterms.referencesBeaton CRCFD, Hervé Abdi. An ExPosition of Multivariate Analysis with the Singular Value Decomposition in R [Internet]. [citado 24 de mayo de 2017]. Disponible en: https://www.utdallas.edu/~herve/abdi-bca2013-Exposition.pdfeng
dcterms.referencesMonfreda M, Gobbi L, Grippa A. Blends of olive oil and seeds oils: characterisation and olive oil quantification using fatty acids composition and chemometric tools. Part II. Food Chem. 15 de febrero de 2014;145:584-92.eng
dcterms.referencesMaleki MR, Mouazen AM, Ramon H, De Baerdemaeker J. Multiplicative Scatter Correction during On-line Measurement with Near Infrared Spectroscopy. Biosyst Eng. marzo de 2007;96(3):427-33.eng
dcterms.referencesLabCognition. Multiplicative Scatter Correction details - EN [Internet]. Analytical Software GmbH &co.KG. [citado 27 de mayo de 2017]. Disponible en: http://www.labcognition.com/onlinehelp/en/multiplicative_scatter_correction.htm.eng
sb.programaMicrobiologíaspa
sb.sedeSede Barranquillaspa

Archivos

Bloque original
Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
PDF.pdf
Tamaño:
257.42 KB
Formato:
Adobe Portable Document Format
Descargar
Bloque de licencias
Mostrando 1 - 1 de 1
No hay miniatura disponible
Nombre:
license.txt
Tamaño:
1.71 KB
Formato:
Item-specific license agreed upon to submission
Descripción:
Descargar

Colecciones

Pregrado

Universidad Simón Bolívar: Todos los derechos reservados / Sistema de biblioteca