Mostrar el registro sencillo del ítem

dc.rights.licenseLicencia de Creative Commons Reconocimiento-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional
dc.contributor.advisorRosado Porto, David
dc.contributor.advisorBadillo Viloria, María
dc.contributor.authorAmaranto Natera, Danna
dc.contributor.authorJiménez Gutiérrez, Dani Luz
dc.contributor.authorSánchez Polo, Daniela
dc.date.accessioned2018-01-19T20:35:55Z
dc.date.available2018-01-19T20:35:55Z
dc.date.issued2016
dc.identifier.urihttp://hdl.handle.net/20.500.12442/1513
dc.description.abstractLa generación de sulfuro de hidrogeno es un problema en la industria petrolera, debido a la corrosión en las estructuras de tuberías, causado por bacterias sulfato reductoras, las cuales poseen una amplia diversidad filogenética que aportan a este tipo de daños. Los genes aprA y dsrA pertenecientes a las bacterias sulfato reductoras están implicados directamente con los procesos de corrosión, estos genes sintetizan dos enzimas claves, la APS reductasa, y APS reductasa desasimilatoria. El presente trabajo de investigación tuvo como objetivo analizar las secuencias de los genes aprA Y dsrA implicados en el proceso de sulfato reducción. Para el cumplimiento de este objetivo; se basó en la recolección de secuencias de diferentes géneros representativos de bacterias sulfato reductoras mediante la utilización de herramientas bioinformáticas y la base de datos del NCBI, permitiendo realizar el análisis de dichas secuencias para determinar el grado de homología establecido y posteriormente diseñar primers para las diferentes bacterias sulfato reductoras encontradas por cada gen. Los resultados obtenidos permitieron determinar homologías similares y algo similares de las diferentes especies estudiadas, porcentajes que varían desde 71%- 100% como ejemplo relevante se encuentran Desulfovibrio piger - Desulfovibrio selexigens estas especie del mismo género presentan secuencias muy similares con un porcentaje de 79 % entre las regiones 480 /2276 y arrojaron dos resultados (76, 100 %) para las secuencias que presentan algo de similitud. De esta manera se pudo determinar mediante análisis descriptivo las homologías de un grupo reducido de bacterias sulfatos reductores mediante la utilización de marcadores genéticos para ello los genes aprA Y dsrA.spa
dc.language.isospaspa
dc.publisherEdiciones Universidad Simón Bolívarspa
dc.publisherFacultad Ciencias Básicas y Biomédicasspa
dc.rightsinfo:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.subjectCorrosiónspa
dc.subjectDesulfovibriospa
dc.subjectBioinformáticaspa
dc.titleAnálisis de homologías de secuencias de los genes aprA y dsrA implicados en el proceso de sulfato reducciónspa
dc.typeOtherspa
dcterms.bibliographicCitationRomero, M., Ocando, L., Huggins, A., Henao, J., Contreras, J., Ramos, M., ... & González, I. (2010). Evaluación de productos de corrosión de sulfuros de hierro generados por Bacterias Sulfato-Reductoras. Ciencia, 18(4).spa
dcterms.bibliographicCitationJesus, E. B., de Andrade Lima, L. R. P., Bernardez, L. A., & Almeida, P. F. (2015). Inhibition of microbial sulfate reduction by molybdate. Brazilian Journal of Petroleum and Gas, 9(3)eng
dcterms.bibliographicCitationTorrado Rincón JR, Calixto Gómez DM, Sarmiento Caraballo AE, Panqueva Álvarez JH. Evaluación del molibdato y nitrato sobre bacterias sulfato-reductoras asociadas a procesos de corrosión en sistemas industriales. Rev Argent Microbiol. 2008; 40(1):52-62.spa
dcterms.bibliographicCitationRincón T, R J, Gómez C, M D, Caraballo S, E A, et al. Evaluación del molibdato y nitrato sobre bacterias sulfato-reductoras asociadas a procesos de corrosión en sistemas industriales. Rev Argent Microbiol. marzo de 2008; 40(1):52-62.spa
dcterms.bibliographicCitationDe Turris, A. J., de Romero, M. F., Papavinasam, S., & Ocando, L. (2013). EFECTO SINÉRGICO DE LAS BACTERIAS SULFATO-REDUCTORAS Y EL CO2 EN AGUA DE PRODUCCI ÓN SOBRE LA CORROSIÓN DEL ACERO AL CARBONO/SYNERGIC EFFECTS OF SULFATE-REDUCING BACTERIA AND CO2 IN PRODUCED WATER ON CARBON STEEL CORROSION. Interciencia, 38(3), 209.spa
dcterms.bibliographicCitationDávila-González, E. M., Bastida-Gonzalez, F. G., Pérez-Méndez, M. J., Guerrero-Barajas, C., & Zarate-Segura, P. B. DETERMINACION DE UN CONSORCIO BACTERIANO EN UN PROCESO DE DESHALOGENACION REDUCTIVA.spa
dcterms.bibliographicCitationSantegoeds, C. M., Ferdelman, T. G., Muyzer, G., & de Beer, D. (1998). Structural and functional dynamics of sulfate-reducing populations in bacterial biofilms. Applied and Environmental Microbiology, 64(10), 3731-3739.eng
dcterms.bibliographicCitationDe Turris AJ, de Romero MF, Papavinasam S, Ocando L. Agresividad corrosiva de un agua de producción por efecto de bacterias sulfato-reductoras. Interciencia. 2012; 37(12):868-74.spa
dcterms.bibliographicCitationMendoza Aguilar DO. Costras biológicas del suelo en ecosistemas semiáridos: composición, rendimiento fisiológico y efecto en la germinación de plantas [Internet]. Universidad Autónoma de Nuevo León; 2014 [citado 30 de septiembre de 2015]. Recuperado a partir de: http://eprints.uanl.mx/4068/1/1080253577.pdfspa
dcterms.bibliographicCitationCruz M, Yisel Y. Bacterias sulfato reductoras. 24 de julio de 2014 [citado 30 de septiembre de 2015]; Recuperado a partir de: http://repository.unimilitar.edu.co/handle/10654/12039spa
dcterms.bibliographicCitationBaumgartner, L. K., Reid, R. P., Dupraz, C., Decho, A. W., Buckley, D. H., Spear, J. R., ... & Visscher, P. T. (2006). Sulfate reducing bacteria in microbial mats: changing paradigms, new discoveries. Sedimentary Geology, 185(3), 131-145eng
dcterms.bibliographicCitationDaumas, S., Cord-Ruwisch, R., & Garcia, J. L. (1988). Desulfotomaculum geothermicum sp. nov., a thermophilic, fatty acid-degrading, sulfate-reducing bacterium isolated with H2 from geothermal ground water. Antonie van Leeuwenhoek, 54(2), 165-178.eng
dcterms.bibliographicCitationWiddel, F., & Bak, F. (1992). Gram-negative mesophilic sulfate-reducing bacteria. In The prokaryotes (pp. 3352-3378). Springer New York.eng
dcterms.bibliographicCitationManz, W., Eisenbrecher, M., Neu, T. R., & Szewzyk, U. (1998). Abundance and spatial organization of Gram-negative sulfate-reducing bacteria in activated sludge investigated by in situ probing with specific 16S rRNA targeted oligonucleotides. FEMS Microbiology Ecology, 25(1), 43-61.eng
dcterms.bibliographicCitationLittle BJ, Mansfeld FB, Arps PJ, Earthman JC. Microbiologically influenced corrosion [Internet]. Wiley Online Library; 2007 [citado 30 de septiembre de 2015]. Recuperado a partir de: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/9783527610426.bard040603/fulleng
dcterms.bibliographicCitationRosnes, J. T., Torsvik, T., & Lien, T. (1991). Spore-forming thermophilic sulfate-reducing bacteria isolated from North Sea oil field waters. Applied and environmental microbiology, 57(8), 2302-2307.eng
dcterms.bibliographicCitationMonroy Cruz YY, others. Bacterias sulfato reductoras. 2014 [citado 28 de mayo de 2015]; Recuperado a partir de: http://repository.unimilitar.edu.co:8080/handle/10654/12039spa
dcterms.bibliographicCitationZverlov, V., Klein, M., Lücker, S., Friedrich, M. W., Kellermann, J., Stahl, D. A., ... & Wagner, M. (2005). Lateral gene transfer of dissimilatory (bi) sulfite reductase revisited. Journal of bacteriology, 187(6), 2203-2208.eng
dcterms.bibliographicCitationWatanabe T, Kojima H, Takano Y, Fukui M. Diversity of sulfur-cycle prokaryotes in freshwater lake sediments investigated using aprA as the functional marker gene. Syst Appl Microbiol. 2013; 36(6):436-43.eng
dcterms.bibliographicCitationBlazejak, A., & Schippers, A. (2011). Real-time PCR quantification and diversity analysis of the functional genes aprA and dsrA of sulfate-reducing prokaryotes in marine sediments of the Peru continental margin and the Black Sea.eng
dcterms.bibliographicCitationMeyer, B., & Kuever, J. (2007). Molecular analysis of the distribution and phylogeny of dissimilatory adenosine-5′-phosphosulfate reductase-encoding genes (aprBA) among sulfur-oxidizing prokaryotes. Microbiology, 153(10), 3478-3498.eng
dcterms.bibliographicCitationMeyer, B., & Kuever, J. (2007). Phylogeny of the alpha and beta subunits of the dissimilatory adenosine-5′-phosphosulfate (APS) reductase from sulfate-reducing prokaryotes–origin and evolution of the dissimilatory sulfate-reduction pathway. Microbiology, 153(7), 2026-2044.eng
dcterms.bibliographicCitationMeyer, B., & Kuever, J. (2008). Homology modeling of dissimilatory APS reductases (AprBA) of sulfur-oxidizing and sulfate-reducing prokaryotes. PLoS One, 3(1), e1514.eng
dcterms.bibliographicCitationFritz, G., Büchert, T., Huber, H., Stetter, K. O., & Kroneck, P. M. (2000). Adenylylsulfate reductases from archaea and bacteria are 1: 1 αβ-heterodimeric iron–sulfur flavoenzymes–high similarity of molecular properties emphasizes their central role in sulfur metabolism. FEBS letters, 473(1), 63-66.eng
dcterms.bibliographicCitationMeyer, B., & Kuever, J. (2007). Molecular analysis of the diversity of sulfate-reducing and sulfur-oxidizing prokaryotes in the environment, using aprA as functional marker gene. Applied and environmental microbiology, 73(23), 7664-7679.eng
dcterms.bibliographicCitationKozak, M. (1999). Initiation of translation in prokaryotes and eukaryotes. Gene,234(2), 187-208eng
dcterms.bibliographicCitationBiderre-Petit, C., Boucher, D., Kuever, J., Alberic, P., Jézéquel, D., Chebance, B., ... & Peyret, P. (2011). Identification of sulfur-cycle prokaryotes in a low-sulfate lake (Lake Pavin) using aprA and 16S rRNA gene markers. Microbial ecology, 61(2), 313-327.eng
dcterms.bibliographicCitationFriedrich, M. W. (2002). Phylogenetic analysis reveals multiple lateral transfers of adenosine-5′-phosphosulfate reductase genes among sulfate-reducing microorganisms. Journal of Bacteriology, 184(1), 278-289.eng
dcterms.bibliographicCitationMüller, A. L., Kjeldsen, K. U., Rattei, T., Pester, M., & Loy, A. (2015). Phylogenetic and environmental diversity of DsrAB-type dissimilatory (bi) sulfite reductases. The ISME journal, 9(5), 1152-1165.eng
dcterms.bibliographicCitationMoreau, J. W., Zierenberg, R. A., & Banfield, J. F. (2010). Diversity of dissimilatory sulfite reductase genes (dsrAB) in a salt marsh impacted by long-term acid mine drainage. Applied and environmental microbiology, 76(14), 4819-4828.eng
dcterms.bibliographicCitationSteger, D., Wentrup, C., Braunegger, C., Deevong, P., Hofer, M., Richter, A., ... & Loy, A. (2011). Microorganisms with novel dissimilatory (bi) sulfite reductase genes are widespread and part of the core microbiota in low-sulfate peatlands. Applied and environmental microbiology, 77(4), 1231-1242.eng
dcterms.bibliographicCitation1Stahl, D. A., Fishbain, S., Klein, M., Baker, B. J., & Wagner, M. (2002). Origins and diversification of sulfate-respiring microorganisms. Antonie van Leeuwenhoek, 81(1-4), 189-195.eng
dcterms.bibliographicCitationDhillon, A., Teske, A., Dillon, J., Stahl, D. A., & Sogin, M. L. (2003). Molecular characterization of sulfate-reducing bacteria in the Guaymas Basin. Applied and Environmental Microbiology, 69(5), 2765-2772.eng
dcterms.bibliographicCitationZhang, W., Song, L. S., Ki, J. S., Lau, C. K., Li, X. D., & Qian, P. Y. (2008). Microbial diversity in polluted harbor sediments II: Sulfate-reducing bacterial community assessment using terminal restriction fragment length polymorphism and clone library of dsrAB gene. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 76(3), 682-691.eng
dcterms.bibliographicCitationLee J-S, White E, Kim SG, Schlesinger SR, Lee SY, Kim S-K. Discovery of a novel adenosine 5′-phosphosulfate (APS) reductase from the methanarcheon Methanocaldococcus jannaschii. Process Biochem. 2011; 46(1):154-61.eng
dcterms.bibliographicCitationHubert, C., & Voordouw, G. (2007). Oil field souring control by nitrate-reducing Sulfurospirillum spp. that outcompete sulfate-reducing bacteria for organic electron donors. Applied and Environmental Microbiology, 73(8), 2644-2652.eng
dcterms.bibliographicCitationMicrosoft Word - Completo.doc - 129160.pdf [Internet]. [citado 30 de septiembre de 2015]. Recuperado a partir de: http://repositorio.uis.edu.co/jspui/bitstream/123456789/195/2/129160.pdfeng
dcterms.bibliographicCitationDuque Z. A review of corrosion by biogenic sulphide in the oil industry. Rev Tec Fac Ing Univ ZULIA. 2007; 30:146-56.eng
dcterms.bibliographicCitationIustman LJR, López NI. Los biosurfactantes y la industria petrolera. Rev Quím [Internet]. 2009 [citado 28 de mayo de 2015]; 8(3). Recuperado a partir de: http://digital.bl.fcen.uba.ar/Download/007_QuimicaViva/007_QuimicaViva_vol08num3.pdfspa
dcterms.bibliographicCitationSchroeder RHA, Rodríguez VID, Hernández LG. Potencial de la biorremediación de suelo y agua impactados por petróleo en el trópico mexicano. Terra. 1999; 17(2):159-74.spa
dcterms.bibliographicCitationde Gil YF, Bruzual Y, de Gómez GL, Rodriguez C, Prin JL, Bravo N. EVALUACIÓN DE LA EFICIENCIA DE BIOCIDA COMO INHIBIDOR DE LA CORROSIÓN INDUCIDA POR MICROORGANISMOS. Rev Latinoam Metal Mater. 2012;(1):8-11.spa
dcterms.bibliographicCitationDuque Z. Una revisión de la corrosión por sulfuro biogénico en la industria petrolera. Rev Téc Fac Ing Univ Zulia. noviembre de 2007; 30(ESPECIAL):146-56.spa
dcterms.bibliographicCitationSantander Morales CB. Estudio Experimental de Corrosión en Metales de Uso Industrial por Desulfovibrio desulfuricans. 2008 [citado 30 de septiembre de 2015]; Recuperado a partir de: http://tesis.uchile.cl/handle/2250/103133spa
dcterms.bibliographicCitationTatusova, T. A., & Madden, T. L. (1999). BLAST 2 Sequences, a new tool for comparing protein and nucleotide sequences. FEMS microbiology letters, 174(2), 247-250.eng
dcterms.bibliographicCitationKlein, M., Friedrich, M., Roger, A. J., Hugenholtz, P., Fishbain, S., Abicht, H., ... & Wagner, M. (2001). Multiple lateral transfers of dissimilatory sulfite reductase genes between major lineages of sulfate-reducing prokaryotes.Journal of Bacteriology, 183(20), 6028-6035.eng
dcterms.bibliographicCitationBen-Dov, E., Brenner, A., & Kushmaro, A. (2007). Quantification of sulfate-reducing bacteria in industrial wastewater, by real-time polymerase chain reaction (PCR) using dsrA and apsA genes. Microbial ecology, 54(3), 439-451.eng
dcterms.bibliographicCitationDevereux, R., Delaney, M., Widdel, F., & Stahl, D. A. (1989). Natural relationships among sulfate-reducing eubacteria. Journal of Bacteriology, 171(12), 6689-6695.eng
dcterms.bibliographicCitationWagner, M., Roger, A. J., Flax, J. L., Brusseau, G. A., & Stahl, D. A. (1998). Phylogeny of dissimilatory sulfite reductases supports an early origin of sulfate respiration. Journal of bacteriology, 180(11), 2975-2982.eng
dcterms.bibliographicCitationOkonechnikov, K., Golosova, O., & Fursov, M. (2012). Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit. Bioinformatics, 28(8), 1166-1167.eng
dcterms.bibliographicCitationKarkhoff-Schweizer, R. R., Huber, D. P., & Voordouw, G. (1995). Conservation of the genes for dissimilatory sulfite reductase from Desulfovibrio vulgaris and Archaeoglobus fulgidus allows their detection by PCR. Applied and environmental microbiology, 61(1), 290-296.eng
sb.sedeSede Barranquillaspa
sb.programaMicrobiologíaspa


Ficheros en el ítem

Thumbnail

Este ítem aparece en la(s) siguiente(s) colección(ones)

Mostrar el registro sencillo del ítem