Examinando por Autor "Lozano Solano, Dayan Surig"
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Ítem Reporte de nueva secuencia genómica del bacteriófago vB_EcoS_BaqEco(Ediciones Universidad Simón Bolívar, 2024) Flórez Osorio, Camila; Lozano Solano, Dayan SurigEscherichia coli (E. coli) es una bacteria comúnmente encontrada en el tracto intestinal de seres humanos y animales de sangre caliente, y aunque muchas de sus cepas son inofensivas, algunas pueden causar graves enfermedades transmitidas a través de los alimentos, como aquellas que producen la toxina Shiga, generando enfermedades como diarrea, infecciones urinarias, sepsis y neumonía. Los bacteriófagos son virus que infectan bacterias y pueden tener un impacto considerable en la biología bacteriana, influenciando procesos como la producción de toxinas y enzimas, así como la transferencia de genes. Dado su potencial en la lucha contra infecciones bacterianas y en la identificación de patógenos, la investigación sobre bacteriófagos es de gran importancia, especialmente en el desarrollo de tratamientos antimicrobianos y en el diagnóstico rápido de infecciones bacterianas. En la investigación microbiológica, compartir los avances genómicos es esencial para el progreso científico. Plataformas públicas como GenBank, que proporciona acceso gratuito a secuencias de proteínas y ADN, juegan un papel crucial en la difusión del conocimiento. GenBank permite a los investigadores acceder a genomas completos, realizar comparaciones genómicas, y estudiar secuencias de ADN de diversas especies, incluyendo bacterias y virus. Esto no solo facilita el avance en áreas como la medicina y la biotecnología, sino que también apoya el diseño de nuevos tratamientos y herramientas basadas en la ingeniería genética. El presente estudio se centró en el aislamiento, caracterización y registro en GenBank del bacteriófago vB_EcoS_BaqEcoB, un fago específico para E. coli. Este fago se obtuvo utilizando la cepa ATCC 25922 de E. coli como huésped para su propagación. El registro de su genoma en GenBank constituye un paso importante en la investigación microbiológica, ya que permite la disponibilidad pública de su secuencia genética para su análisis y comparación con otras secuencias de fagos. El genoma de vB_EcoS_BaqEcoB fue secuenciado mediante la plataforma Illumina, utilizando el método de lecturas pareadas y ensamblaje con el software Spades V. 3.11.0. Además, se realizó la anotación de las secuencias codificantes de proteínas (CDS) mediante la plataforma online RAST-tk, identificando 131 CDS, de las cuales 27 presentaron una función predicha. El genoma de vB_EcoS_BaqEcoB es de ADN de doble cadena (dsDNA) con una longitud de 75,909 pares de bases y un contenido de G+C del 42.1%. Este bacteriófago es clasificado como un miembro de la familia Siphoviridae, dado que presenta una cápside icosaédrica no envuelta y una cola larga, flexible y no contráctil, características comunes en los fagos de esta familia. En términos de su comportamiento en medios de cultivo, vB_EcoS_BaqEcoB genera placas de lisis grandes en el medio LB, lo que indica su capacidad para infectar y lisar eficazmente a E. coli. El registro en GenBank de este fago no solo proporciona una fuente valiosa de información genética para futuros estudios, sino que también facilita la investigación comparativa y el diseño de terapias antimicrobianas específicas. La disponibilidad de secuencias genómicas de bacteriófagos específicos para E. coli, como vB_EcoS_BaqEcoB, abre nuevas posibilidades para desarrollar tratamientos biológicos que utilicen fagos como agentes terapéuticos, una alternativa prometedora frente a la creciente resistencia a antibióticos en bacterias patógenas. En la discusión, se destaca la importancia de plataformas como GenBank para el acceso global a secuencias genómicas, lo que permite que los científicos compartan sus hallazgos y trabajen en colaboración a nivel internacional. La divulgación de datos genómicos, como en este caso, contribuye al avance en la comprensión de las interacciones entre bacterias y sus fagos, lo que puede mejorar las estrategias para tratar infecciones bacterianas de manera más eficiente. Este tipo de investigaciones también tiene un impacto significativo en áreas como la agricultura y la producción de energía sostenible, donde los fagos pueden ser utilizados para controlar patógenos en cultivos o incluso en el tratamiento de residuos orgánicos. El estudio también resalta el potencial de los bacteriófagos en la medicina moderna. El uso de bacteriófagos como terapia antimicrobiana, en particular frente a infecciones causadas por bacterias multirresistentes, es una alternativa en auge. La capacidad de los fagos para infectar y destruir bacterias específicas, sin afectar a las células humanas, ofrece un enfoque muy preciso y eficiente para combatir infecciones resistentes. La información sobre los fagos, como la presentada en este estudio, será clave para el desarrollo de terapias de fagoterapia personalizadas, que complementen o incluso reemplacen los antibióticos tradicionales. En conclusión, el aislamiento, la caracterización y el registro en GenBank del bacteriófago vB_EcoS_BaqEcoB representan un avance significativo en la investigación microbiológica. La disponibilidad pública de su genoma facilita el análisis y la comparación con otros fagos, lo que permite el desarrollo de tratamientos antimicrobianos más específicos y efectivos. Este estudio no solo contribuye al entendimiento de las interacciones entre fagos y bacterias, sino que también abre nuevas vías para el desarrollo de terapias innovadoras en la lucha contra las infecciones bacterianas.